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Programmieren in der Bioinformatik mit Perl |
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Authors:
Alexander Picker, Europäisches Lernlabor für
die Biowissenschaften (ELLS) am EMBL, Heidelberg,
Norbert Müller, Landesinstitut für Erziehung
und Unterricht/ZPG Bioinformatik
Description:
Bioinformatik ist ein neues Forschungsgebiet an der
Schnittstelle zwischen klassischer Laborbiologie und
Informatik. Nur mithilfe von Computern können Massendaten
aus Genom-Sequenzier-Projekten oder DNA-Chip-Experimenten
gespeichert und analysiert werden. Spezielle Computerprogramme
helfen heute den Wissenschaftlern ihre Arbeit in den
Kontext der ständig wachsenden, öffentlichen
Datenberge zu stellen. Dieser Kurs ist als Einführung
in die Computer-Programmierung, wie sie heute in der
Bioinformatik stattfindet, konzipiert worden. Anhand
der Programmiersprache Perl lernen Sie, wie man Computer-Programme
erstellen kann, die einfache wissenschaftliche Fragestellungen,
insbesondere aus dem Bereich der biologischen Sequenzanalyse,
lösen können.
Target Audience:
Der Kurs richtet sich an Lehrer ohne Vorkenntnisse in
der Computer-Programmierung, insbesondere aus den Fachrichtungen
Biologie, Biotechnologie, Bioinformatik, Datenverarbeitung,
Informatik. Die 10 Blöcke dieses Kurses wurden
im Dezember 2003 und Februar 2004 mit grossem Erfolg
an der Landesakademie für Fortbildung und Personalentwicklung
an Schulen, Esslingen, Deutschland im Rahmen von zwei
Lehrerfortbildungsveranstaltungen an einem 'gemischten
Publikum erprobt'.
Topics Context:
Bioinformatik,
Datenverarbeitung, Molekulare Genetik
Materialien Herunterladen:
Blöcke
1: Das erste Perl Programm – Datenausgabe
auf dem Bildschirm [PDF]
Blöcke
2: Modifizieren der Dateneingabe und Datenausgabe
[PDF]
Blöcke
3: Manipulierung von Variablen [PDF]
Blöcke
4: Listen in Perl: Daten des Typs Array und Hash
[PDF]
Blöcke
5: Kontrolle des Programmflusses mit Bedingungen
und Schleifen [PDF]
Blöcke
6: Wiederholung and Zusammenfassung der Blöcke
1-5 [PDF]
Blöcke
7: Subroutinen, Funktionen und prozedurales Programmieren
[PDF]
Blöcke
8: Mustererkennung und reguläre Ausdrücke
[PDF]
Blöcke
9: Das erste komplexe Programm – Restrict.pl
[PDF]
Blöcke
10: Das erste komplexe Programm – Restrict.pl
[PDF]
Liesmich:
Konfigurierung der Programmierumgebung [PDF]
Programmtexte:
Alle Perl Programme und Quelldaten –
[.sit]
[.tgz]
[.zip] |
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